10月の最終週からアップデートの通知が来ているかと思いますが

手動によるアップデートと、夜間自動アップデートが選べるそうで、夜間に実施する方が多いようですが、その更新作業に伴い、目覚ましなどのアラーム設定が初期化されてしまうバグが存在するんだそうで。
巷では、翌日に寝坊をした！などの騒ぎになっているようです。

当面の対処方法は？

起きている間に、手動でアップデートを実施し、該当個所のアラーム設定を自身で確認するか、
もう少し待って、9.1アップデート側の対策が済むまで (9.1.1 ?) 待たれるのが宜しいかと。